FlowJo™ 软件世界

数据分析是流式细胞术实验中极其重要的部分。FlowJo™软件是一款强大的工具，可帮助科学家进一步获得免疫学和免疫表型结果。2020 年，FlowJo™ 软件在领先的免疫学同行评审期刊中被引用的频率高于任何其他流式细胞术分析软件。

FlowJo™软件用户享有大量专业 BD 应用科学家的支持和帮助。想知道 BD FlowJo™软件专家提供什么？本月我们很高兴采访 BD 应用科学家 Serena Di Cecilia 博士，他帮助 BD 客户充分利用他们的流式数据。

您能给我们介绍一下 FlowJo™软件的功能吗？

FlowJo™软件是用于流式细胞术数据分析的全能程序，科学家在交流分析时使用的语言。作为桌面应用程序，它允许处理来自不同仪器的流式细胞仪标准文件，从而能够分析免疫表型、细胞周期、增殖、动力学和高维数据。用户友好的界面和创建统计数据的能力使用户可以获得完整的报告，包括准备发布的图像和数据。

插件为 FlowJo™软件添加了新功能。在过去几年中，该产品有何变化，主要驱动因素是什么？

大约 3 年前，当我加入FlowJo团队时，我们几乎没有可用的插件，包括tSNE。算法的计算量很大，用户不知道 FlowJo™软件 [必须提供] 的所有可能性。几年来，我们已经开发和发布了30多个插件，并且我们每个月都在不断地发布和更新插件。鉴于tSNE算法被科学界越来越多地使用，它已嵌入到软件中。改进的细胞仪和荧光染料需要新的分析方法才能真正理解现在可以获得的信息丰富的数据。我们不断开发新插件以满足用户的需求，并经常与他们合作，推动降维、聚类和数据可视化工具，从而发现以前未表征的细胞群。

流式细胞术数据处理中最常见的挑战是什么，FlowJo™软件如何帮助解决这些挑战？

随着实验中可以包含的参数数量增加，挑战之一是在进入分析步骤之前获得高质量的数据。幸运的是，BD为面板设计提供了强大的科学支持，FlowJo™软件中提供了三种不同的插件用于数据质量处理——FlowAI、FlowClean 和 CytoNorm。有时，研究人员对他们从单个实验中获得的数据量感到不知所措，并认为拥有生物信息学知识对于他们能够分析数据至关重要。FlowJo™软件为高维数据分析打开了大门，只需点击一下鼠标，就无需知道如何编码。为了完成一个无需编码的计算工作流程，用户可以使用 tSNE、UMAP 或 triMAP 进行降维；Phenograph、FlowSOM 和Xshift计算生成的群体可以使用ClusterExplorer 进行探索，或者通过HyperFinder启用的计算排序进行排序。

BD 提供的各种 FlowJo™软件培训计划有哪些？

FlowJo网站是一个知识宝库。作为应用科学家，我们每月为 FlowJo™软件的基本和高级功能举办实时网络研讨会。用户可以与我们互动并实时提问或观看网站上提供的录制的网络研讨会。完整的FlowJo文档可用于解决他们可能有的任何疑问或问题，FlowJo大学可帮助用户在实验运行且没有太多时间观看完整的网络研讨会时通过短视频入门或找到提示和技巧。尽管如此，每个站点的面对面培训仍然是我的最爱！